一、核心结论先知道
变更股东（股权转让）主要涉及3种税：转让方需缴个人所得税或企业所得税，转让方与受让方均需缴印花税。2025年新规延续小型微利企业税收优惠至2027年，且电子化申报更普及。关键要合规定价，留存凭证，避免税务风险。
二、三大核心税种：谁交？交多少？
1. 企业所得税（企业转让方）
政策依据：《企业所得税法》第四条、第十六条
计税规则：应纳税额=（转让收入-股权成本-合理费用）×税率。收入含现金、实物等全部对价；成本是取得股权的出资额及费用。
税率：一般25%，小型微利企业20%（2025年优惠延期）。
举例：以1000万转让股权，成本600万，费用50万，应纳税额=（1000-600-50）×25%=87.5万。
2. 个人所得税（自然人转让方）
政策依据：《个人所得税法》第三条、67号公告
计税规则：应纳税额=（转让收入-股权成本-合理费用）×20%。收入含违约金、补偿金等所有收益。
特殊情况：低价转让无正当理由（如低于净资产），税务机关可核定收入。
举例：500万转让股权，成本300万，税费10万，应纳税额=（500-300-10）×20%=38万。
3. 印花税（双方均缴）
政策依据：《印花税法》第五条及附件
计税规则：按股权转让协议金额（不含税）的万分之五缴纳，双方各承担一半。
举例：协议金额2000万，双方各缴2000×0.05%=1万。
三、特殊情形税务处理指南
1. 股权继承与无偿转让
继承：需缴印花税（万分之五）；法定继承免个税，遗嘱继承若无偿受赠需缴20%个税。
无偿转让：直系亲属间转让免个税（需亲属证明），其他情况可能被核定征税。
2. 非居民企业股权转让
预提所得税：转让境内企业股权，按10%税率缴纳，符合税收协定可降至5%或免征。
合规要求：需提交《非居民企业股权转让信息报告表》，受让方可能需代扣代缴。
四、2025年申报实操全流程
1. 准备资料
股权转让合同、双方身份证明；
股权成本凭证（如出资证明）、合理费用票据；
需评估的提供中介机构评估报告；
特殊情形需额外资料（如亲属关系证明）。
2. 申报时间与渠道
个人所得税：受让方代扣代缴，次月15日内通过自然人电子税务局申报。
企业所得税：季度或年度汇算清缴时，通过电子税务局申报，需关联申报。
印花税：协议签订后15日内，在电子税务局或办税服务厅申报。
3. 关键操作提示
受让方要督促转让方完税，避免后续追责；
被投资企业需5日内报送股权变动决议至税务机关。
五、风险防范与合规建议
1. 常见风险点
低价转让无正当理由，被核定补税；
未按时申报，需缴滞纳金（日万分之五）；
受让方未代扣代缴个税，面临罚款。
2. 实用避坑指南
合理定价：保留评估报告、付款记录，避免1元转让；
利用优惠：小型微利企业申请20%企业所得税税率；
跨境筹划：通过税收协定降低预提所得税；
资料留存：完税证明、合同等保存至少10年。
六、2025新规核心变化解读
优惠延期：小型微利企业股权转让所得减免政策延至2027年（财政部2025年5号公告）。
跨境强化：非居民企业转让需主动报告，税务机关可追征税款。
申报便利：个税、企业所得税均可全程电子化办理，无需跑大厅。
结语
股东变更税务处理看似复杂，其实抓住“税种对应主体、计税依据法定、申报及时合规”三个核心就能少走弯路。2025年政策既延续优惠，又强化监管，建议转让前梳理股权成本，必要时咨询专业税务机构，避免因小失大。毕竟合规纳税才是最稳妥的“省钱”方式。